YSD-200系列電磁流量計另外一個主要的故障點就是運行期故障，運行期故障一般由儀表的傳感器內部附著層、雷擊和環境條件變化等因素引起的。運行期故障是電磁流量計經調試并正常運行一段時期后出現的故障。
(1)傳感器內壁附著層：由于電磁流量計測量含有懸浮固相或污臟體的機會遠比其他流量儀表多，出現內壁附著層產生的故障概率也就相對較高。若附著層電導率與液體電導率相近，儀表還能正常輸出信號，只是改變流通面積，形成測量誤差的隱性故障；若是高電導率附著層，電極間電動勢將被短路：若是絕緣性附著層，電極表面被絕緣而斷開測量電路。所以，應及時清除電磁流量計測量管內的附著結垢層。(2)雷電打擊雷擊容易在儀表線路中感應出高電壓和浪涌電流，使儀表損壞。它主要通過電源線或勵磁線圈或傳感器與轉換器之間的流量信號線等途徑引入，尤其是從控制室電源線引入占絕大部分。
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